国家生物信息中心相助研究判断青少年早发性痛风新危害基因位点
痛风是由血清尿酸升高引起的代谢性疾病 ，多爆发于成年男性 。在全球规模内患病率急剧增添且泛起显着年轻化趋势 ，并在枢纽畸形、肝肾功效受损及引发心血管疾病等方面临青少年康健造成了严重威胁 。现在针对青少年痛风（发病年岁≤19岁）遗传机制及致病机理的研究较少 ，现已成为青少年痛风防治的瓶颈 。故针对青少年痛盛行列的遗传研究不但能为痛风的机制提供新的看法 ，也能为青少年痛风患者提供新的治疗靶点 。
8月8日 ，国家生物信息中心偏向东团队和青岛大学隶属医院李长贵团队相助 ，在Arthritis & Rheumatology?期刊在线揭晓了题为“Novel genetic loci in early-onset gout derived from whole genome sequencing of an adolescent gout cohort”的研究论文 ，周全形貌了青少年痛风患者基因组特征并确定了早发性痛风的新危害位点 ，将有助于更好地相识青少年爆发性痛风的发病机制 ，为危害展望和干预预防青少年早发性痛风提供主要依据 。
该研究对905名青少年痛风发明行枚举行了全基因组测序 ，描绘了青少年痛风和高尿酸血症的基因组图谱 ，并通过全基因组关联剖析、序列内核关联测试和全转录组关联剖析 ，以及在2834例早发性痛风验证后的荟萃剖析 ，判断出两个新的基因座（Pmeta < 5.0×10-8）：RCOR1（rs12887440与rs8009475）和FSTL5-MIR4454（rs35213808） ，提醒可能与早发性痛风相关 。
与RCOR1?相关的两个最显著关联SNV位于RCOR1?的启动子（rs8009475）和第二个内含子（rs12887440） 。在痛风相关细胞和组织中 ，包括rs12887440的区域富含活性组卵白修饰标记（H3K4me1和H3K27ac） ，为潜在的增强子 ，并通过远程染色质构象相互作用调理启动子 ，提醒rs12887440（A为危害等位基因）可能影响RCOR1?的表达 。本研究进一步通过RT-qPCR和RNA测序 ，在32名青少年痛风患者的全血中验证了rs12887440-AA携带者中RCOR1 mRNA水平显着高于非携带者rs12887440-GG ，证实rs12887440与RCOR1?的表达有关 。而rs12887440-AA与rs12887440-GG携带者之间的差别表达基因加入免疫系统历程、免疫反应、顺应性免疫反应、免疫反应调控等免疫相关通路 ，且rs12887440和rs8009475与尿酸水平无关 ，提醒RCOR1?可能加入痛风爆发的炎症历程 。通过THP-1巨噬细胞敲除实验验证发明 ，袒露于尿酸盐晶体刺激免疫反应后 ，RCOR1?敲低细胞中细胞内IL-1β前体卵白水平和上清液中IL-1β卵白水平显著降低 ，批注RCOR1?可能起劲加入痛风炎症的生长 ，对尿酸盐晶体炎症反应的更大敏感性可能是早期爆发痛风的主要缘故原由 。
别的 ，研究团队正在一连构建中国痛盛行列 ，增添行列数目与行列数据种类 ，并荟萃多种组学数据建设痛风多组学数据库 。充分使用痛盛行列与数据库建设 ，在已有研究基础上使用痛风SNV举行痛风分型 ，或在痛风危害评分的基础上使用SNV团结临床表型 ，并进一步团结多组学提升痛风分型准确率 ，建设适用于亚洲人的危害评分模子 ，对痛风举行临床指导 ，提升危害展望能力 。该研究系统不但增进了医学研究与临床实践的深度融合 ，还对提升慢性重大疾病的防治水平、改善患者生涯质量具有主要意义 。
青岛大学隶属医院季爱昌博士、国家生物信息中心隋阳博士、青岛大学隶属医院薛晓梅、纪晓朋、国家生物信息中心时文睿博士、上海交通大学BIO-X研究院师咏勇研究员为本文的配合第一作者 ，青岛大学隶属医院李长贵主任医师、国家生物信息中心偏向东研究员、渠鸿竹副研究员、以及美国阿拉巴马大学Tony R. Merriman教授为本文配合通讯作者 。该研究获得了国家重点研发妄想、国家自然科学基金等项目资助 。
青少年早发性痛风新危害基因判断及功效研究
论文链接
