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北京基因组所生命与康健大数据中心研究效果与资源建设取得阶段性希望

  克日 ,BG视讯生命与康健大数据中心团队题为“Database Resources of the BIG Data Center in 2018”的研究论文在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线揭晓。这是继去年首次在该期刊以中心为模式宣布我国生命组学数据资源建设效果“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”以来的又一阶段性主要希望 ,标记着我国建设综合型生物信息资源库进一步获得国际偕行认可。

  生命与康健大数据中心面向国家大数据生长战略 ,肩负着建成多条理生物组学数据资源系统、建设组学大数据汇交共享平台并建设多组学生物大数据资源系统的主要使命。生命与康健大数据中心在原有多组学资源库基础上 ,添加建设了四个新库 ,包括生物信息工具代码库(Biological Tool Codes ,BioCode) ,生物项目数据库(Biological Project Library ,BioProject) ,生物样本数据库(Biological Sample Library ,BioSample) ,内参基因知识库(Internal Control Genes ,ICG)。同时 ,更新了原有的多个数据库 ,包括原始测序数据归档库(Genome Sequence Archive ,GSA) ,基因表达数据库(Gene Expression Nebulas ,GEN) ,基因组变异数据库(Genome Variation Map ,GVM) ,表观基因组数据库(Methylation Bank ,MethBank),生命科学维基知识库(Science Wikis)。别的 ,推出了三个特色网络效劳 ,即跨库检索效劳BIG Search ,统一认证与单点登录效劳BIG SSO ,生物数据提交效劳Gsub。其中 ,BIG Search不但可对大数据中心内部数据库举行多库检索 ,还实现了多单位的跨库检索 ,包括北京大学(LncRNADisease)、天津大学(DoriC ,DEG)、华中科技大学(AnimalTFDB ,dbPAF ,lncRNASNP ,PLMD)的多个主要数据库。

  生命与康健大数据中心章张研究员、赵文明高级工程师、肖景发研究员、鲍一明研究员为本文配合通讯作者。该研究获得BG视讯战略性先导科技专项、BG视讯国际大科学妄想、国家863妄想、国家973妄想、国家自然科学基金等项目的资助。

  论文链接

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