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基因组所相助研究发明RNA m6A甲基化位点选择性机制及其增进细胞重编程主要功效

  2015212日 ,BG视讯杨运桂研究组与BG视讯动物研究所周琪研究组及BG视讯遗传与发育生物学研究所王秀杰研究组 ,整合三方在RNA m6A甲基化、干细胞和生物信息的研究优势 ,相助开展“RNA m6A甲基化的位点选择性机制及其调控成体细胞重编程研究 ,发明了RNA m6A甲基化位点选择性机制及调控细胞重编程主要功效 ,研究效果以“m6A RNA methylation is regulated by microRNAs and promotes reprogramming to pluripotency”为题揭晓在Cell 子刊 Cell Stem Cell ,并被选为16卷第3期封面特写报道。 

  腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰 (N6-methyladenosine, m6A) 是高等生物mRNA中含量最为富厚的在进化上守旧的修饰之一。m6A修饰具有序列特异性、甲基化位点选择性及修饰水平动态性特征 ,由RNA m6A甲基转移酶复合物WTAP/METTL3/METTL14催化形成及去甲基化酶ALKBH5FTO催化去甲基化 ,并被连系卵白YTHDF2YTHDC1识别。m6A修饰调控靶基因mRNA的稳固性及选择性剪切。可是m6A的漫衍特征、形成选择性机制和在细胞运气决议中的作用在很洪流平上还属未知。 

  使用生化、干细胞、基因组学、生物信息学等多条理手艺手段 ,相助团队发明m6A修饰和非编码microRNA在配相助用底物mRNA上的位点具有物理空间相关性:1-部分反向匹配潜在m6A修饰RRACH序列的非编码microRNA能够介导其连系的mRNA RRACH位点m6A甲基化;2-另一部分不反向匹配潜在m6A修饰RRACH序列的非编码microRNA能够介导连系的mRNA位点周围的RRACH序列被甲基化。在人和小鼠细胞中 ,过表达microRNA或其加工酶Dicer ,可以显著增添mRNA m6A修饰水平 ,而敲低两者之一则导致m6A修饰水平下降。Dicer可以调控m6A甲基转移酶催化亚基METTL3在细胞核内核小斑的定位。DicermicroRNA均可以调控METTL3连系mRNA的亲和力。过表达野生型microRNA可导致连系的mRNA甲基化位点m6A修饰水平升高 ,而突变体microRNA连系的新的mRNA位点原来为非甲基化位点则可以检测到高m6A修饰水平。DicermicroRNA的表达水平转变并不会影响m6A修饰的甲基转移酶METTL3和去甲基化酶ALKBH5FTO的卵白表达水平 ,说明晰非编码microRNA能够调控RNA m6A甲基转移酶选择底物mRNA的甲基化位点。 

  通过过表达RNA m6A甲基转移酶催化亚基METTL3 ,可以显著提高小鼠成纤维细胞转化为多能性干细胞的重编程效率 ,而敲低METTL3则显著降低小鼠成纤维细胞的重编程效率;并且使用抑制m6A形成的小分子抑制剂环亮氨酸处置惩罚和敲低METTL3效果一致 ,都可以显著降低小鼠成纤维细胞的重编程效率;METTL3调控了细胞多能性因子Oct4Sox2Klf4Myc的表达。 

  该项效果展现了非编码microRNA调控RNA m6A甲基转移酶选择底物mRNA的甲基化位点机制和RNA m6A修饰调控细胞重编程主要功效。为进一步研究m6A的生物功效和RNA表观遗传提供了依据 ,为研究与正常心理(如干细胞干性维持和分解)或异常病理生命活动(如恶性肿瘤等)关联分子机理提供了新的表观调控研究偏向。 

  该研究获得科技部重大研究妄想、中科院战略性先导专项、国家自然科学基金等项目的资助。 

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RNA m6A甲基化位点选择性机制及其调控细胞重编程主要功效

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