基因组卵白质组与生物信息学报首批在线预揭晓文章上线
克日,由BG视讯主理的全英文学术期刊——《基因组卵白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, GPB),首批在线预揭晓(Article-in-Press)文章乐成上线。此次该刊物在线预揭晓功效的开通与使用,关于资助科研职员实时揭晓自己的最新研究效果,使读者快速相识海内外的最新研究希望,以及提升GPB期刊的影响力都将起到起劲作用。
自2003年创刊的近十年来,GBP一直遵照古板按期揭晓文章的出书模式,但随着人们对信息时效性的需求日益增添,为了缩随笔章的揭晓周期,改善按期出书期刊的滞后性,从2012年6月最先,GPB将所有经由偕行评议被接受的稿件,在ScienceDirect数据库中率先以在线预揭晓的形式提前揭晓,让文章更早地与读者晤面,供各人阅读、引用。本期首批预揭晓的7篇文章,各人可通过以下先容先睹为快:
1. 本刊主编于军研究员就其十五年来关于基因组转录方面的研究效果揭晓了简短谈论,对一些问题举行了更深入的思索,并对一些古板看法提出了新的挑战。
2. 全基因组序列剖析是生物信息学和盘算生物学研究的基础,Bilal Wajid等人对已往数十年Genome Assembler的研究事情举行了总结,对二代测序手艺的一样平常算法特点举行了综述,为初学者和感兴趣职员相识本事域提供了很好的资助。
3. 在于军研究员和胡松年研究员的指导下,崔鹏、刘万飞、赵宇慧等人对三甲基化组卵白H3赖氨酸4(H3K4me3)举行了研究。他们通过较量小鼠大脑和睾丸组织中H3K4me3、H3K27me3的基因组图谱,发明该基因修饰与组织特异性表达、功效和发育亲近相关。
4. 以上研究小组的研究还发明H3K4me3在正义基因3′端有显著富集,被称为3′-H3K4me3,3′-H3K4me3区域可能是作为反义转录的潜在启动子而施展作用,而这一征象可能在真核生物中普遍保存。
5. 小麦白粉病是由于熏染白粉病菌引起的,可导致小麦减产。本刊编委王向峰先生与中国农业大学孙其信、解超杰先生等人相助,对两种差别基因型(易感、抗。┬÷笤诎追鄄【厩昂蟮囊镀傩辛俗甲榻狭垦芯。效果批注,抗白粉病是一种由大宗基因加入调控的极端重大的系统反应。
6.水牛是一种主要家畜,但其全基因组序列信息尚需完善。Subhash J. Jakhesara等人使用水牛肌肉组织泉源的cDNA作探针,从其基因组中捕获Tissue Specific Temporal外显子并举行454测序,以展现该物种的肌肉组织特异性基因和单核苷酸多态性,为研究尚未完玉成基因组测序物种的编码序列变异情形,提供了新的战略。
7. 非编码RNA(ncRNA)在转录水平调理基因表达方面起主要作用,但仍有许多ncRNA尚有待进一步被发明。Michael Bao等人研发了一种基于ab initio的寻找基因组序列中ncRNA的新要领——ncRNAscout。与古板要领相比,该要领由于加入了最小自由能t-scores和SVP值这两个参数,因此能更准确地定位基因组中的ncRNA序列。该工具可在http://bioinformatics.njit.edu/ncRNAscout使用。
注:如您想阅读文章全文,请上岸GPB期刊预揭晓文章原文链接:http://www.sciencedirect.com/science/journal/aip/16720229.





